V sobotu 14. července 2007 se v železniční stanici Čerčany odehrála tragická selhání komunikace a procedury, které vedly k železniční nehodě. V 10:06 hodin zde rychlík číslo 633 narazil do odstavené soupravy osobního vlaku 9122. Při kolizi zemřel strojvedoucí odstaveného vlaku, zranilo se pět cestujících v rychlíku a rovněž jeho strojvedoucí.

Okolnosti byly vázány na probíhající maintenance trati. V den nehody byla na trati číslo 221 v úseku Senohraby – Čerčany vyhlášena výluka jedné z kolejí, což znamenalo, že vlaky v obou směrech musely jezdit po jediné koleji. Osobní vlak z Prahy přijel na první staniční kolej v 9:34 a skončil zde svou jízdu. Po výstupu cestujících byla souprava složená ze dvou elektrických jednotek řady 451 rozpojena na dvě části a posunuta k benešovskému zhlaví.

V 9:50 si hlavní výpravčí ověřil, že externí výpravčí převzal službu, a poté si odskočil na osobní potřebu a nákup jídla. Přibližně hodinu později, těsně před desátou, přijížděl od Prahy rychlík 633 vedený lokomotivou řady 363. Výpravčí vnější služby vydal pokyn pro vlakovou cestu po první staniční koleji, i když věděl, že je obsazena dvěma jednotkami. Signalisté pokyn provedli a připravili vlakovou cestu.

Rychlík vjížděl do Čerčan na přivolávací návěst, která předepisuje jízdu podle viditelnosti, maximálně 40 kilometrů za hodinu. Když byl vlak na vstupném zhlaví, spojil se výpravčí se strojvedoucím a sdělil mu neformálně: „jo na odjezdu máš volno fíro jo." Strojvedoucí reagoval kladně a zvýšil rychlost až na 46 kilometrů za hodinu. Díky záhybu trati v oblasti stanice zaregistroval odstavenou jednotku velmi pozdě, až když byla již velmi blízko. Přestože ihned zavedl rychločinné brzdění, souprava stále jela rychlostí 33 kilometrů za hodinu, když do stojící jednotky narazila.

Náraz byl silný – posunul jednotku o dvanáct metrů a vytlačil její čelo do vzduchu. Strojvedoucí odstaveného vlaku, který měl poslední šanci reagovat, při nárazu zemřel. V rychlíku se zranilo dalších šest osob.

Drážní inspekce jasně určila viníka: dovolení vjezdu na obsazenou kolej a nedodržení podmínek bezpečné jízdy. Okresní soud v Benešově obžaloval výpravčího, jednoho ze signalistů a strojvedoucího rychlíku. Výpravčí a signalista se viny přiznali, přestože poukazovali na ztížené podmínky vlivem modernizace. Výpravčí také hovořil o zdravotních problémech a užívání léků. Oba dostali podmíněné tresty. Strojvedoucí rychlíku vinu odmítl a tvrdil, že se mohl spravedlivě domnívat, že má kolej volnou. Také byl odsouzen na podmínku.

V roce 2009 rozhodl Městský soud v Praze, že České dráhy musí poskytnout rodinám pozůstalých po zemřelém strojvedoucím odškodnění ve výši 400 tisíc korun na osobu.