Kostel svatého Václava a svaté Anežky České v Hustopči je farním chrámem nejprve známým svou moderní stavbou, kterou v podstatě není — pod tímto jménem skrývá jeho dlouhou a dramatickou minulost. Dnešní budova pochází z let 1992–1994 a je součástí farnosti Hustopeče u Brna. Její příběh však začíná několik set let dříve.

Původní kostel na dnešním Dukelském náměstí vznikl pravděpodobně se založením města ve druhé polovině 13. století. První dochovaná zmínka o něm je z roku 1324. Během 14. století byla původní stavba rozšířena o novou loď o rozměrech zhruba 22 × 11 metrů a na severní straně vybudována věž. Na konci tohoto století přibyla další přístavba u severní stěny.

Na přelomu 15. a 16. století se kostel značně přestavěl. Vznikla kaple svatého Jana na severní straně, která nahradila starší stavby. Mezi lety 1512 a 1517 se postavil mohutný presbytář se síťovou klenbou a kostelní loď byla nově zaklenuta křížovou klenbou — úpravy, které mu daly stálou pozdně gotickou podobu. Věž byla později, zejména v 16. století, upravena renesančně. Další úpravy se provedly v letech 1858 a 1903. Věž postupně dosáhla výšky 74 metrů, leč byla postavena na nestabilním podloží, což od konce 19. století vedlo k jejímu znatelném naklonění.

Druhá světová válka přinesla kostelu vážná poškození a po jejím skončení neproběhly žádné opravy. Budova postupně chátrahala. V roce 1953 se na věži objevily nebezpečné trhliny. Kombinace statických problémů a vibrací z rostoucí automobilové dopravy — kolem kostela vedla státní silnice Brno–Bratislava — vyvrcholila v noci na 26. února 1961 zřícením věže. Přestože presbytář s architektonicky cennou klenbou zůstal neporušen, tehdejší úřady se rozhodly pro demolici celého objektu. Přes protesty veřejnosti byla demolice provedena v září 1962. Zachráněno bylo pouze vnitřní vybavení a některé architektonické prvky.

Myšlenka na nový kostel se objevila již v 70. letech, ale uskutečnit ji bylo možné až po roce 1989. Základní kámen byl posvěcen 22. dubna 1990 na Velehradě papežem Janem Pavlem II. během jeho první návštěvy Československa. Na podobu nového chrámu byla vyhlášena soutěž, do níž se hlásilo dvacet architektů. Vítězem se stal návrh brněnského výtvarníka Ludvíka Kolka — stavby ve tvaru spirály s věží, určené pro 250–300 osob.

Stavební práce začaly v dubnu 1992 a trvaly 2,5 roku. Sloučená vysvěcení provedlo 25. září 1994 biskupem Vojtěchem Cikrlem. V roce 1995 byly pořízeny čtyři zvony, v roce 1997 nové varhany. Náklady dosáhly 27,5 milionů korun, financované státním příspěvkem, sponzorskými dary a příspěvky věřících, zejména z Německa a Rakouska.